Πολυπληθής Ερευνητική Ομάδα υπό τον Ερευνητή του Altius Institute for Biomedical Sciences – Σιάτλ (ΗΠΑ) Δρ. Jeff Vierstra και την Επίκουρη Καθηγήτρια του Τμήματος Βιολογίας του ΑΠΘ Δρ. Νικολέττα Ψαθά ανέπτυξε μία μέθοδο ελέγχου για την αναζήτηση υποψήφιων ρυθμιστικών ακολουθιών από δεδομένα μεγάλης κλίμακας επιγονιδιωματικής (epigenomics) για προγραμματιζόμενη διαγονιδιακή έκφραση εντός φορέων σχεδιασμένων για γονιδιακή θεραπεία. Η έρευνά τους δημοσιεύθηκε στο Nature Communications.
Καθώς η έκφραση των γονιδίων κατά την ανάπτυξη και διαφοροποίηση των κυττάρων ρυθμίζεται από απομακρυσμένα ρυθμιστικά στοιχεία που τροποποιούν με ακρίβεια τη γονιδιακή δραστηριότητα ανάλογα με το κύτταρο, οι φορείς της γονιδιακής θεραπείας εκμεταλλεύονται αυτά τα στοιχεία για την τοπο- και χρονο –ειδική έκφραση των διαγονιδίων.
Πραγματοποιήθηκε η αξιολόγηση μίας βιβλιοθήκης 15.000 σύντομων ακολουθιών που προέρχονται από αναπτυξιακά ενεργά στοιχεία κατά τη διάρκεια της ερυθροποίησης, χρησιμοποιώντας έναν κλινικά σχετικό φορέα αναφοράς. Αυτά τα στοιχεία εμφανίζουν μία διαβάθμιση μεταγραφικής δραστηριότητας ενισχυτή σε ερυθροειδή κύτταρα, με υψηλή εξειδίκευση όσον αφορά στον κυτταρικό τύπο, αλλά και στο αναπτυξιακό στάδιο.
Τέλος, η αντικατάσταση της κανονικής ρυθμιστικής αλληλουχίας μLCR της β-σφαιρίνης, με έναν συμπαγή ενισχυτή που έχει εισαχθεί σε ένα λεντι-ϊκό φορέα για β-θαλασσαιμία μπορεί και διορθώνει επιτυχώς το θαλασσαιμικό φαινότυπο σε αιματοποιητικά βλαστικά προγονικά κύτταρα (HSPCs) τα οποία προέρχονται από ασθενείς, ενώ αυξάνει τη συγκέντρωση του ιού και τη δυνατότητα των κυττάρων να λαμβάνουν εξωγενές γενετικό υλικό (cell transducibility). Η προσέγγισή αυτή μπορεί να παράσχει περαιτέρω γνώσεις για τη βιολογία των ενισχυτών με ευρύτερες επιπτώσεις για τη γονιδιακή θεραπεία στον άνθρωπο.